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毅硕Sentieon | 陆地棉(Gossypium hirsutum)全基因组WGS分析流程
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Sentieon | 发布V202503.01版本
# 一、Sentieon最新版本V202503.01 Sentieon团队持续优化升级产品,现已发布V202503.01版本。本文将详细介绍此次更新中的重要功能改进和问题修复,以帮助您更好地了解和使用最新版本。  <center>图1 Sentieon V202503.01版手册目录</center> --- # 二、下载链接 - **新版本的Sentieon软件包:** https://insvast-download.oss-cn-shanghai.aliyuncs.com/Sentieon/release/sentieon-genomics-202503.01.tar.gz - **PDF格式的手册(英文):** https://insvast-download.oss-cn-shanghai.aliyuncs.com/Sentieon/release/mannual/Sentieon_Mannual_EN_V202503.01.pdf - **PDF格式的手册(中文):** https://insvast-download.oss-cn-shanghai.aliyuncs.com/Sentieon/release/mannual/Sentieon_Mannual_CN_V202503.01.pdf - **Sentieon示例脚本:** https://github.com/Sentieon/sentieon-scripts/ - **适用于不同测序平台的 DNAscope 模型:** https://github.com/Sentieon/sentieon-models/ --- # 三、更新要点 Sentieon软件最新版本(V202503.01)的更新主要聚焦于性能优化和稳定性提升两个方面: - 在性能优化方面,显著提升了DNAscope模块的运算速度,大大改善了整体运行效率; - 在稳定性提升方面,修复了以下关键问题,包括TNscope在检测体细胞扩增子数据时产生的假阳性、在个别情况下CRAM文件产生格式错误、在基于共识的重复序列去除时输入带UMI的RNA读段产生的断言失败,以及DNAscope在检测非人样本时机器学习模型导致的段错误等问题; 关于Sentieon_V202503.01版本更新内容,详细列表整理如下: | 类型 | 描述 | | --- | --- | |新功能 | 提高了DNAscope模型的应用速度 | | 错误修复 | 解决了TNscope在体细胞扩增子数据中可能产生假阳性的问题 | |错误修复 | 解决了在罕见情况下CRAM文件可能产生格式错误的问题 | | 错误修复 | 解决了在基于共识的重复序列去除中,输入带有UMI的RNA读段时可能导致的断言失败问题 | |错误修复 | 解决了DNAscope在非人类样本使用机器学习模型时导致段错误的问题 | --- # 四、运行效率测试 Sentieon此次测试采用标准人类30XWGS数据,测序平台为MGISEQ,数据总量达到104GBase,测试样本为NA12878。通过对新旧版本分析流程的对比评估,结果显示新版本(V202503.01)在BAM文件到VCF文件的变异检测分析过程中,处理速度整体提升了3倍,大幅缩短了基因组二级分析时间。 Sentieon DNAscope 新旧版本的运行效率比较如下表所示: | 软件版本 | 模块 | 类型(WGX 30X) | 64线程服务器 | | --- | --- | --- | --- | | Sentieon_ 202503.01 |DNAscope | 单样本 | 15min 14s | |Sentieon_ 202503. |DNAscope | 单样本 | 45min 57s |
chsnp
2026年1月7日 10:03
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