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ARM平台-物种测试分析
## 背景 本文集收录我司基于ARM计算服务器平台,采用Sentieon软件对部分物种进行测试分析的时间统计数据,旨在为您提供评估参考。鉴于测试过程中可能存在不足之处,我们诚恳地希望得到您的宝贵意见和建议,以便在后续的测试环节中不断改进和完善。 ## 测试方案 为了确保测试结果的准确性和可比性,我们将采用相同的测序数据及参考基因组,并在同一测试环境下,通过调整不同CPU核心数量来执行分析任务,记录各分析环节所需时间。这不仅有助于我们了解不同CPU核心配置对分析效率的影响,还能够为未来的性能优化提供数据支持。 ## 测试环境概述 1. CPU型号:AmprerOne A192 - 32X 2. 系统环境:Ubuntu 24.04 3. 软件版本:Sentieon202503 4. 测试分析环节:从Fastq到VCF的数据处理流程。这一流程涵盖了从原始测序数据(Fastq)到变异检测结果(VCF)的全部环节步骤。
stlee
2025年11月10日 17:01
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