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猪(Sus scrofa)变异检测分析流程
### Ⅰ、测试物种信息 **1. 测试物种**:猪(Sus scrofa) **2. 物种倍性**:二倍体 **3. 测试数据**:自有数据 **4. 测序平台**:/ **5. Raw_Reads**:157609730 **6.Raw_Bases**:23.64G **7.测序深度**:9.98X **8.参考基因组**:Sus_scrofa.Sscrofa11.1.dna.toplevel.fa **9.参考基因组大小**:2.37G **10.测试流程**:从Fastq到VCF全分析流程 ### Ⅱ、测试环境 **1. 测试平台**:Ampere 2U机架式服务器(工程验证机) **2. CPU型号**:单颗ApereOne A192-32X(ARM架构、192个内核、基准主频3.2GHz) **3. 内存配置**:512GB **4. 系统环境**:Ubuntu 24.04 **5. 测试方案**:为了确保测试结果的准确性和可比性,我们将采用相同的测序数据及参考基因组,并在同一测试环境下,通过调整不同CPU核心数量(16核、32核、64核、96核、128核)来执行分析任务,记录各分析环节所需时间; ### Ⅲ、测试结论(分项时间)  ### Ⅳ、测试结论(总耗时)  ### Ⅴ、测试分析流程步骤 http://doc.insvast.com/doc/21/ ### Ⅵ、联系我们  官网:www.chsnp.com 邮箱:info@chsnp.com 电话:020-22076772 地址:广州市番禺区南村镇汇智二路236号华新汇1座2803单元
stlee
2025年11月11日 15:13
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